食堂處理不科學等難題較為出色，如消毒碗筷、防鼠、防蠅、防塵和污水排放、存放廢物、廢棄物處置、冷藏保鮮等根底設備結束并投入使用，但還需要進一步對這些 設備更新完善；操作間功用分區不明顯，如生、熟食物簡略失調，粗、精加工食物設備清洗不嚴肅，這都必將給食堂食物安全帶來了許多風險。
食堂員工查核方法尚不科學不悉數，特別是對員工的測評規范不可規范和細化，處理員只是通過往常作業情況進行片面判定，對員工不能做出悉數的客觀評價，這就致使員工的作業熱心也隨之降低。具體有四個難題：
1、在搶先班組、優異員工評選上還存在互相“推讓”，輪流“榮獲”的情況。
2、鼓舞獎懲機制不可健全，隨意性大，獎懲作用不可明顯，致使單個員工出現違章違紀、不思進取、投機取巧等不良風氣。
3、高校將食堂處理也按八小時上班制，食堂開飯時辰卻是處理人員下班了，然后無法有用處理和查核班組的作業，嚴肅損傷員工的積極性。
4、蘇州食堂承包對食堂的管理應嚴肅恪守各項已擬定的規章制度，不能因為食堂員工屬輔佐人員，不保證食堂員工應有的待遇和獎勵，這會致使作業積極性受到影響。